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edico基因组与英特尔公司合作解决大数据瓶颈

放大字体  缩小字体 发布日期:2015-04-22  来源:药品资讯网  浏览次数:144
摘 要:圣地亚哥edico基因组昨日(4月21日)宣布,该公司将与英特尔公司合作,利用英特尔的氙气处理器来解决对关注越来越多下一代测序(

圣地亚哥edico基因组昨日(4月21日)宣布,该公司(http://www.chemdrug.com/company/)将与英特尔公司合作,利用英特尔的氙气处理器来解决对关注越来越多下一代测序(NGS)的数据分析(http://www.chemdrug.com/sell/76/)

  目前,英特尔的氙气处理器可以采取至少10小时的使用标准来析一个完整的基因组。edico基因与英特尔的合使研究人员能实时够完成中小学NGS分析。

  edico基因组的首席执行官Pieter van Rooyen博士表示“edico基因组的DRAGEN™,是世界上第一个生物信息处理器,目前正在帮助临床医生和研究人员克服快速分析大数据的NGS工作流程中的一个重要瓶颈。我们期待着与英特尔合作,提供了一个功能强大的基因组学分析解决方案”

  此外,此次合作加快部署DRAGEN™到世界各地英特尔的客户群,大大扩展了我们的生物信息处理的使用范围。”

  edico和英特尔之间的合作伙伴关系的重点是加快NGS数据分析,以满足临床基因组学和医学的精度,这正是英特尔持续关注的需求。去年,英特尔和Broad研究所合作,优化了常用的基因组学分析的管道,广泛的基因组分析工具包(GATK),英特尔Xeon Powered服务器。和他们结合,对整个人类基因组分析的时间能够从三天缩短到一天。现在,edico和英特尔技术比全基因组分析的速度快70倍,在20分钟内就能完成分析。

  “在整个行业中,大数据的需求正在推动通用处理的极限,创造优化的解决方案,能够保持与特定的数据处理需求的机会”英特尔生命科学总经理Ketan paranjape解释到。。“由于使用NGS数据分析的增长,我们的许多客户,包括医院和研究机构,有需要的解决方案,可以快速和高效的处理和分析这些海量数据。在基因组学分析的舞台,edico基因组的重要领域的专业知识,让他们在这个垂直空间拥有理想合作伙伴。”

  这是一个非常需要的合作,因为它解决了目前所面临基因组学领域中的最大的瓶颈之一。从这种合作产生的解决方案应该提供更高的精度,降低总体NGS成本,简化数据分析。并协助需要大数据集的共享应用,如人口规模的基因组数据分析。

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