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粉尘螨变应原第6组分全长cDNA克隆及生物信息学分析

放大字体  缩小字体 更新日期:2018-11-21  浏览次数:6
摘 要:目的:获得粉尘螨变应原第6组分编码基因并了解其分子特征。方法:根据GeneBank已公布的Derf6核酸序列设计引物,用RT-PCR扩增获得其编码基因,插入pMD19-T载体进行序列测定和生物信息学分
  • 【题 名】粉尘螨变应原第6组分全长cDNA克隆及生物信息学分析
  • 【作 者】崔玉宝 周鹰 彭江龙 孙炜 王颖
  • 【机 构】[1]盐城卫生职业技术学院病原生物学教研室,盐城224006 [2]海南医学院海南省热带病重点实验室,海口571101
  • 【刊 名】《中国免疫学杂志》 2009年第25卷第7期,641-646页
  • 【关键词】粉尘螨 变应原 克隆 生物信息学
  • 【文 摘】目的:获得粉尘螨变应原第6组分编码基因并了解其分子特征。方法:根据GeneBank已公布的Derf6核酸序列设计引物,用RT-PCR扩增获得其编码基因,插入pMD19-T载体进行序列测定和生物信息学分析。结果:获得的Der f6 cD-NA全长为840 bp,与参考序列同源性达96.8%,含1个完整的开放读码框。推测编码蛋白由279个氨基酸组成,信号肽序列位于1~19 aa,亲水性指数为-0.139,跨膜区域位于1~19 aa,二级结构由α-螺旋(7.17%)、延伸主链(36.56%)和无规卷曲(56.27%)组成;亚细胞定位于细胞外,N-端第6位和第11位的亮氨酸有明显的序列核输出信号;可能为糜蛋白酶,具有cAMP和cGMP依赖的蛋白激酶磷酸化位点、蛋白激酶C磷酸化位点、酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、N端酰基化位点等。结论:获得了Derf6基因全长,其编码的细胞外疏水性蛋白可能具有糜蛋白酶活性。
 
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