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苏云金杆菌Ⅰ型抗癌晶体蛋白的分子模建

放大字体  缩小字体 更新日期:2018-11-26  浏览次数:9
摘 要:通过同源建模,得到Ⅰ型抗癌晶体蛋白Parasporin-1的初始三维结构.经分子动力学方法优化后,利用Ramachandran Plot检测和结构匹配等方法对模型进行评价.结果显示,结构模型中的键长、
  • 【题 名】苏云金杆菌Ⅰ型抗癌晶体蛋白的分子模建
  • 【作 者】袁宇熹 张同武 陈智山 林毅
  • 【机 构】华侨大学化工学院 福建泉州362021
  • 【刊 名】《华侨大学学报:自然科学版》2009年 第4期 420-424页 共5页
  • 【关键词】Ⅰ型抗癌晶体蛋白 同源建模 分子动力学模拟 蛋白酶 激活位点
  • 【文 摘】通过同源建模,得到Ⅰ型抗癌晶体蛋白Parasporin-1的初始三维结构.经分子动力学方法优化后,利用Ramachandran Plot检测和结构匹配等方法对模型进行评价.结果显示,结构模型中的键长、键角及二面角的分布合理,与模板蛋白的主链a碳原子的均方根差值为0.537592,在合理范围之内.此外,通过分析Parasporin-1结构域I中的β-loop-β结构片段,推测出第2个蛋白酶处理激活位点的位置在两个芳香族疏水性氨基酸F167与Y168之间.
 
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  • (1) Ⅰ型抗癌晶体蛋白,同源建模,分子动力学模拟,蛋白酶,激活位点
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