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番茄SlmiR393基因超表达载体的构建及其靶基因鉴定

放大字体  缩小字体 更新日期:2018-11-26  浏览次数:9
摘 要:为研究番茄(Lycopersicum esculentum)的SlmiR393基因功能,采用生物信息学方法从番茄基因组数据库中获得SlmiR393的前体序列及其潜在的靶基因。以基因组DNA为模板,克隆
  • 【题 名】番茄SlmiR393基因超表达载体的构建及其靶基因鉴定
  • 【作 者】林冬波 杨迎伍 李正国
  • 【机 构】重庆大学生命科学学院基因工程研究中心 重庆400030
  • 【刊 名】《热带亚热带植物学报》2013年 第2期 133-140页 共8页
  • 【关键词】番茄 SlmiR393 生长素受体同源基因 载体构建
  • 【文 摘】为研究番茄(Lycopersicum esculentum)的SlmiR393基因功能,采用生物信息学方法从番茄基因组数据库中获得SlmiR393的前体序列及其潜在的靶基因。以基因组DNA为模板,克隆了番茄SlmiR393前体基因并整合到pLP35S.100植物表达载体;采用5’RACERT-PCR技术验证SlmiR393对预测靶基因mRNA的剪切作用,采用定量PCR技术检测SlmiR393及其靶标基因在番茄不同组织的表达。结果表明,SlmiR393的前体序列含有完整的茎环结构;成熟miR393与3个生长素受体同源基因(SITIRl、SITIRl-likel和SIAFB)之间具有识别作用位点。SlmiR393可对番茄3个靶基因的转录本进行剪切降解;SlmiR393与3个不同靶基因(SITIRl、SITIRl.1ikel和SIAFB)的表达模式在叶和茎、花蕾、花中存在一定的互补关系。因此,推断番茄中的SlmiR393可能在特定的组织或发育时期介导特定的靶基因mRNA的剪切降解,初步证实生长素受体同源基因为SlmiR393的靶基因。此外,成功构建以CaMV35S为启动子的植物表达载体pLP35S-pre.S/miR393,为深入研究SlmiR393在番茄生长素信号转导中的功能奠定了基础。
 
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