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基于金钗石斛EST的短串联重复序列的挖掘

放大字体  缩小字体 更新日期:2018-11-26  浏览次数:3
摘 要:利用计算机程序搜索了金钗石斛EST上的短串联重复位点,共获得2 122个基序长度2-7 bp,STR长度不小于12 bp且重复次数不小于3的STR位点.其中,3 bp-STR最为丰富,而2 bp和6
  • 【题 名】基于金钗石斛EST的短串联重复序列的挖掘
  • 【作 者】梁山 陈莉莉 李洪清
  • 【机 构】广东省植物发育工程重点实验室 华南师范大学生命科学学院 广东广州510631
  • 【刊 名】《华南师范大学学报:自然科学版》2011年 第2期 113-118页 共6页
  • 【关键词】金钗石斛 短串联重复 表达序列标签
  • 【文 摘】利用计算机程序搜索了金钗石斛EST上的短串联重复位点,共获得2 122个基序长度2-7 bp,STR长度不小于12 bp且重复次数不小于3的STR位点.其中,3 bp-STR最为丰富,而2 bp和6 bp基序的STR位点在可表达基因中富集.金钗石斛基因组存在439个基因特异分布的STR位点,暗示这些STR位点可能与特定的功能基因共进化.
 
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