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赤点石斑鱼ICLP基因的克隆和序列分析

放大字体  缩小字体 更新日期:2016-02-07  浏览次数:0
摘 要:MHC class II invariant chain-like proteins(ICLP)因子与免疫反应密切相关,其参与对抗原的处理,保证多肽不被进一步降鹪为氨基酸.通过RACE反应获得赤点石斑
  • 【题 名】赤点石斑鱼ICLP基因的克隆和序列分析
  • 【作 者】王颖[1] 张之文[1] 丁少雄[1] 杜佳莹[1] 施晓峰[1] 陈晓峰[2]
  • 【机 构】[1]厦门大学海洋与环境学院,福建厦门361005 [2]国家海洋局第三海洋研究所,福建厦门361005
  • 【刊 名】《厦门大学学报:自然科学版》 2009年第48卷第3期,428-434页
  • 【关键词】赤点石斑鱼 ICLP基因 序列分析
  • 【文 摘】MHC class II invariant chain-like proteins(ICLP)因子与免疫反应密切相关,其参与对抗原的处理,保证多肽不被进一步降鹪为氨基酸.通过RACE反应获得赤点石斑鱼ICLP2cDNA全序列,全长1837bp,包括44bp的5’UTR区,861bp的开放阅读框以及932bp的3’UTR区.编码286个氨基酸,推测的蛋白质分子量为31878u.对赤点石斑鱼10个组织的1CLP2基因进行PCR扩增和测序,结果表明赤点石斑鱼ICLP2基因的表达不存在组织特异性.此外,氨基酸序列同源比对的结果表明。赤点石斑鱼与其它16种脊椎动物ICLP2的相似度在25%~78%之间.与狼鲈和鳜鱼ICLP2因子的同源程度最高,分别为78%和74%.根据ICLP的氨基酸序列构建的脊椎动物系统进化树,表明了该分子的氨基酸序列可以作为研究鱼类物种间进化关系的良好指标.
 
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