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八肋游仆虫中ECD1基因的克隆及序列分析

放大字体  缩小字体 更新日期:2016-02-07  浏览次数:0
摘 要:含有CHROMO(chromatin organization modifier)结构域的蛋白参与了异染色质的形成及转录沉默复合物的形成.原生动物游仆虫细胞中既含有转录活跃的大核也含有转录沉默的小核.
  • 【题 名】八肋游仆虫中ECD1基因的克隆及序列分析
  • 【作 者】党旭红 许静 李江姣 梁爱华 王伟
  • 【机 构】山西大学生物技术研究所,化学生物学与分子工程教育部重点实验室,山西太原030006
  • 【刊 名】《山西大学学报:自然科学版》 2009年第32卷第2期,273-279页
  • 【关键词】CHROMO结构域 八肋游仆虫 ECD1基因 基因克隆 序列分析
  • 【文 摘】含有CHROMO(chromatin organization modifier)结构域的蛋白参与了异染色质的形成及转录沉默复合物的形成.原生动物游仆虫细胞中既含有转录活跃的大核也含有转录沉默的小核.本实验应用PCR技术从八肋游仆虫(Euplotes octocarinatus)中获得了一个编码含有CHROMO结构域的基因ECD1(Euplotes chromo domain-con-taining protein 1)(GeneBank登录号为FJ357578).大核中含有该基因的微小染色体全长1105 bp.小核中该基因内无内部删除序列IES的存在.通过RT-PCR,证实该基因开放阅读框为645 bp.大核基因中含有三个内含子,转录过程中这些内含子均符合一类内含子GU-AG剪切规则.DNAstar软件分析,该基因编码的蛋白质包含214个氨基酸,分子量24.7 kDa,等电点为5.48.结构域聚类分析表明Ecd1蛋白可能执行与四膜虫异染色质蛋白Pdd1p和Pdd3p相似功能,参与大核发育过程中异染色质的形成和IES序列的删除.
 
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