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小鼠睾丸新基因TSEG-2的克隆及表达分析

放大字体  缩小字体 更新日期:2016-02-09  浏览次数:1
摘 要:目的:利用生物信息学手段克隆小鼠睾丸特异性基因TSEG-2。方法:从二级表达序列标签(EST)数据库ZooDDD中获得小鼠正常睾丸表达的EST,通过dbEST数据库检索出与其高度同源的EST序列,构建
  • 【题 名】小鼠睾丸新基因TSEG-2的克隆及表达分析
  • 【作 者】王智宇 童强松 曾甫清 刘媛 顾朝辉 郑丽端 蔡嘉斌 蒋国松
  • 【机 构】华中科技大学同济医学院附属协和医院外科 湖北武汉430022 华中科技大学同济医学院附属协和医院病理科 湖北武汉430022
  • 【刊 名】《中华男科学杂志》2009年 第2期 99-105页 共7页
  • 【关键词】TSEG-2 睾丸 表达序列标签 生物信息学 小鼠
  • 【文 摘】目的:利用生物信息学手段克隆小鼠睾丸特异性基因TSEG-2。方法:从二级表达序列标签(EST)数据库ZooDDD中获得小鼠正常睾丸表达的EST,通过dbEST数据库检索出与其高度同源的EST序列,构建EST叠加群,Biolign软件拼接,GeneScan软件预测contigs对应的基因组序列中的外显子、内含子;针对开放阅读框设计引物序列,采用RT-PCR从小鼠睾丸组织中克隆新基因的cDNA,分析该基因在小鼠睾丸不同发育阶段、隐睾中及各脏器中的表达,并对测序结果进行生物信息学分析。结果:成功克隆了小鼠睾丸新基因TSEG-2,全长451bp,开放阅读框为267bp,编码88个氨基酸。RT-PCR证实该基因开放阅读框正确,TSEG-2在小鼠睾丸组织中高表达,在4、9、14、18、21、38日龄和2、6月龄小鼠睾丸组织中呈现规律性表达,在隐睾组织中表达减弱,且与小鼠其他cDNA无同源性,获得GenBank登录号EU079025。功能区分析发现,小鼠TSEG-2cDNA序列定位于染色体15qE3,为可溶性非分泌型蛋白,有2个可能的蛋白激酶C(PKC)磷酸化位点,1个酪蛋白激酶Ⅱ(CK2)磷酸化位点,并可能是一种核蛋白。结论:获得小鼠睾丸特异性表达基因TSEG-2,诱导小鼠隐睾发生的17-β雌二醇可引发基因TSEG-2的下调,为进一步研究该基因的生物学功能和表达调控奠定了基础。
 
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  • (1) TSEG-2,睾丸,表达序列标签,生物信息学,小鼠
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