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北京地区流行性腮腺炎野病毒与疫苗病毒基因特征比较

放大字体  缩小字体 更新日期:2016-02-09  浏览次数:0
摘 要:目的比较北京地区流行性腮腺炎病毒流行株和疫苗株的基因特征,初步分析疫苗效果不佳的原因。方法通过病例免疫史分析、病毒分离鉴定、SH基因序列分析,与其他基因型参考株进行同源性比较及血凝素-神经氨酸酶(HN
  • 【题 名】北京地区流行性腮腺炎野病毒与疫苗病毒基因特征比较
  • 【作 者】陈萌 张铁钢 陈丽娟 吴疆 杨洁 张伟
  • 【机 构】北京市疾病预防控制中心 中国医学科学院中国协和医科大学基础医学研究所
  • 【刊 名】《中华流行病学杂志》2009年 第11期 1184-1188页 共5页
  • 【关键词】流行性腮腺炎病毒 疫苗 基因型
  • 【文 摘】目的比较北京地区流行性腮腺炎病毒流行株和疫苗株的基因特征,初步分析疫苗效果不佳的原因。方法通过病例免疫史分析、病毒分离鉴定、SH基因序列分析,与其他基因型参考株进行同源性比较及血凝素-神经氨酸酶(HN)基因氨基酸关键位点变异分析。结果病毒分离阳性病例共38例,其中IgM阴性7例。在2007和2008年,病毒分离率、RT-PCR阳性率、IgM抗体阳性率都有明显下降,同时有免疫史的病例增多。实验证明无免疫史的病例病毒分离和IgM抗体阳性率更高。38株病毒均属于F基因型,疫苗株属于A基因型。SH基因流行株之间核苷酸最大差异为5.6%,与疫苗株的差异为16.0%-18.1%。部分北京株SH蛋白中保守的疏水性氨基酸发生变化,如第8位:6株L→F。各流行株之间HN蛋白氨基酸序列最大差异为2.3%,与疫苗株差异为4.2%-5.3%。在HN上决定交叉中和能力的氨基酸位点,北京株与疫苗株存在差异,如在354位和356位,所有北京株与疫苗株都不同。北京株在HN上的N-糖基化位点也和疫苗株存在差异,如在464―466位置上为NCS,疫苗株为NCR。另有18个未知功能的氨基酸位点,所有北京株与疫苗株不同。结论近年北京地区流行的腮腺炎病毒优势株为F基因型,未发现基因型间变异,已存在较大型内差异。北京株和疫苗株在SH和HN蛋白上都存在较大差异。
 
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