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中国宿主动物中Amur汉坦病毒M片段全基因序列分析

放大字体  缩小字体 更新日期:2016-02-09  浏览次数:21
摘 要:目的测定中国宿主动物中Amur病毒M片段全基因序列,以了解其分子特征。方法设计特异的PCR引物,用RT-PCR法分段扩增JilinAP06株M片段全长,PCR产物经克隆后进行序列测定,然后进行系统发育
  • 【题 名】中国宿主动物中Amur汉坦病毒M片段全基因序列分析
  • 【作 者】郭卫东 张文义 江佳富 池海谊 王文瑞 王中元 金鹰 杨红 方立群 曹务春
  • 【机 构】内蒙古自治区疾病预防控制中心 呼和浩特010031 军事医学科学院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室 呼和浩特市第一医院 黑龙江省韦河林业局卫生防疫站
  • 【刊 名】《中华流行病学杂志》2009年 第10期 1051-1054页 共4页
  • 【关键词】汉坦病毒 Amur病毒 M片段 序列分析
  • 【文 摘】目的测定中国宿主动物中Amur病毒M片段全基因序列,以了解其分子特征。方法设计特异的PCR引物,用RT-PCR法分段扩增JilinAP06株M片段全长,PCR产物经克隆后进行序列测定,然后进行系统发育分析和重组分析。结果JilinAP06株M片段全基因序列共3615个核苷酸,A+T含量为59.3%,G+C含量为40.7%,包含1个单一的开放读码框架,其最大读码框架从41-3448,由3408个核苷酸组成,共编码1135个氨基酸。序列同源分析表明,JilinAP06株与中国的人源Amur HV株同源性为96.0%-97.8%,与韩国大林姬鼠来源的SoochongHV同源性为85.6%.86.7%,与HTNV原型株76―118同源性仅为79.5%,而与其他各型病毒间的同源性均低于79.0%。氨基酸同源分析,其氨基酸序列与中国的人源株Amtll-HV同源性为98.1%~98.4%,与韩国大林姬鼠来源的Soochong HV同源性为96.4%-97.0%,与HTNV原型株76―118同源性为91.7%,而与其他各型病毒间的同源性均低于92.0%。系统发育分析结果显示,JilinAP06与Amur病毒构成一个相对独立的分支。结论从中国宿主动物中获得了AmurHV的M片段全基因序列。
 
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