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浙江省野生动物鼬獾狂犬病毒全基因组序列测定分析

放大字体  缩小字体 更新日期:2016-02-09  浏览次数:1
摘 要:目的测定浙江省分离的2株野生动物鼬獾狂犬病毒株全基因组序列,从分子水平进行遗传变异特征分析,了解狂犬病毒在浙江省的流行和变异情况。方法RT-PCR测定鼬獾狂犬病毒株全基因组核苷酸序列,并进行基因序列和
  • 【题 名】浙江省野生动物鼬獾狂犬病毒全基因组序列测定分析
  • 【作 者】雷永良 王晓光 柳付明 陈秀英 叶碧峰 梅建华 兰进权 唐青
  • 【机 构】浙江省丽水市疾病预防控制中心 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所
  • 【刊 名】《中华流行病学杂志》2009年 第8期 824-828页 共5页
  • 【关键词】狂犬病毒 鼬獾 全基因组 序列分析
  • 【文 摘】目的测定浙江省分离的2株野生动物鼬獾狂犬病毒株全基因组序列,从分子水平进行遗传变异特征分析,了解狂犬病毒在浙江省的流行和变异情况。方法RT-PCR测定鼬獾狂犬病毒株全基因组核苷酸序列,并进行基因序列和编码蛋白相似性比较及种系发生分析。结果测序获得2株鼬獾狂犬病毒全基因组核苷酸序列信息:基因组全长11923nts,leader长58nts,由5个编码区组成:NP(1353nts)、PP(894nts)、MP(609nts)、GP(1575nts)、LP(6386nts),N―P―M―G间隔序列长2、5、5nts;G―L基因间伪基因Ψ长423nts;trailer长70nts。核酸BLAST及多序列比对显示,浙江省鼬獾狂犬病毒株全基因组序列的组成和结构符合弹状病毒科狂犬病毒属特征;鼬獾病毒株负链RNA基因组5个基因编码氨基酸的长度没有变异,编码区基因没有发生重组,编码蛋白仅表现较少的序列变化,多数只发生碱基的替代;中国病毒株之间特别是同种动物狂犬病毒之间各个基因区域核苷酸与氨基酸序列相似性最高,鼬獾狂犬病毒基因组序列相似性在氨基酸水平明显高于核苷酸水平,蛋白质编码基因的核苷酸变异大多属于同义突变。结论鼬獾狂犬病毒与研究中选择的代表性疫苗株或者街毒株的变异位点和变异类型相似,多序列相似性比较和N基因种系发生分析显示,鼬獾狂犬病毒均属于基因1型,具有中国地域性特点,2株野生动物鼬獾狂犬病毒极有可能是存在于自然界中固有的街毒株。
 
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