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河北省2株汉城病毒的遗传特征分析

放大字体  缩小字体 更新日期:2016-02-09  浏览次数:1
摘 要:目的 对河北省2株汉城病毒(SEOV)进行基因分型及系统进化分析.方法 用RT-PCR法扩增SEOV Li株和LF18株的S与M全基因片段;利用DNAStar软件分析S与M基因片段核苷酸序列同源性;利
  • 【题 名】河北省2株汉城病毒的遗传特征分析
  • 【作 者】郭文平 林献丹 王文 李明慧 朱会宾 张永振
  • 【机 构】石河子大学生命科学学院 温州市疾病预防控制中心 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室 河北省疾病预防控制中心
  • 【刊 名】《中华流行病学杂志》2010年 第8期 916-919页 共4页
  • 【关键词】汉城病毒 系统进化分析
  • 【文 摘】目的 对河北省2株汉城病毒(SEOV)进行基因分型及系统进化分析.方法 用RT-PCR法扩增SEOV Li株和LF18株的S与M全基因片段;利用DNAStar软件分析S与M基因片段核苷酸序列同源性;利用Phylip软件构建系统进化树.结果 Li株与LFl8株的全S基因片段均由1772个核苷酸组成,开放阅读框(ORF)的位置均为43~1332核苷酸,编码429个氨基酸的核蛋白.2株病毒的M片段全基因序列均由3653个核苷酸组成,ORF的位置均为49~3450核苷酸,编码1133个氨基酸的糖蛋白前体.2株病毒的糖蛋白前体有62个半胱氨酸残基以及6个糖基化位点.2株病毒的全S、M基因片段的核苷酸序列与包括疫苗株L99、Gou3、Z37在内的已知SEOV的同源性分别为87.6%~99.2%和83.6%~97.3%.全S和全M基因片段构建的系统进化树显示2株病毒均为SEOV第Ⅲ亚型.结论 Li株和LF18株都属于SEOV,为SEOV的第Ⅲ亚型.河北省汉坦病毒的流行毒株的遗传特征与疫苗株Z37相似.
 
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